home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00201 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.8 KB  |  41 lines
  1. *********************************************************
  2. * Tau and MAP proteins tubulin-binding domain signature *
  3. *********************************************************
  4.  
  5. Microtubules consist  of tubulins  as well  as a group of  additional proteins
  6. collectively known as the Microtubule Associated  Proteins (MAP).   MAP's have
  7. been   classified into  two  classes:  high   molecular  weight  MAP's and Tau
  8. protein. These   proteins   promote   microtubule   assembly   and   stabilize
  9. microtubules. The  C-terminal  region of  a  subset of these proteins contains
  10. three or four tandem repeats  of a conserved domain of about thirty amino acid
  11. residues which  is  implicated  in  tubulin-binding  and which seems to have a
  12. stiffening effect  on  microtubules.  The  proteins currently known to contain
  13. such repeats are:
  14.  
  15.  - Tau [1], from neurones.
  16.  - MAP2 [2], a neuronal member of the high molecular weight MAP's.
  17.  - MAP4 [3], a non-neuronal member of the high molecular weight MAP's. MAP4 is
  18.    is also expressed in some neurons.
  19.  
  20. The pattern  we  developed  to  detect  this  repeated  region  spans the last
  21. thirteen residues of the repeated region.
  22.  
  23. -Consensus pattern: G-S-x(2)-N-x(2)-H-x-[PA]-[AG]-G(2)
  24. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  25. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  26.  
  27. -Note: the first repeat of MAP2 is not picked up by the pattern because it has
  28.  Tyr instead of His in position 8, and Lys instead of Gly in position 11.
  29.  
  30. -Expert(s) to contact by email: Matus A.
  31.                                 matus@fmi.ch
  32.  
  33. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  34.  
  35. [ 1] Kosik K.S., Orecchio L.D., Bakalis S., Neve R.L.
  36.      Neuron 2:1389-1397(1989).
  37. [ 2] Matus A.
  38.      Trends Neurosci. 17:19-22(1994).
  39. [ 3] Chapin S.J., Bulinski J.C.
  40.      J. Cell Sci. 98:27-36(1991).
  41.